Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms