Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HJURPQ8NCD3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms