Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CLDN19Q8N6F1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CLDN19Q8N6F1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CLDN19Q8N6F1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CLDN19Q8N6F1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CLDN19Q8N6F1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CLDN19Q8N6F1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CLDN19Q8N6F1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CLDN19Q8N6F1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN19Q8N6F1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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