Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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