Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CATSPER4Q7RTX7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms