Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSTM1Q6UX27 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms