Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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MED27Q6P2C8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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