Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARHGAP40Q5TG30 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms