Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT24Q2M2I5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms