Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPROQ16827 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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