Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NPTX1Q15818 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NPTX1Q15818 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NPTX1Q15818 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NPTX1Q15818 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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