Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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