Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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