Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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LAPTM4AQ15012 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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LAPTM4AQ15012 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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LAPTM4AQ15012 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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LAPTM4AQ15012 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LAPTM4AQ15012 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LAPTM4AQ15012 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LAPTM4AQ15012 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LAPTM4AQ15012 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LAPTM4AQ15012 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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