Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSPNQ14714 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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