Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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COL4A6Q14031 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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COL4A6Q14031 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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