Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMB3Q13751 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms