Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms