Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SGCGQ13326 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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