Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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