Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms