Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHDQ02161 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHDQ02161 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHDQ02161 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RHDQ02161 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHDQ02161 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHDQ02161 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHDQ02161 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHDQ02161 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHDQ02161 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHDQ02161 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHDQ02161 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHDQ02161 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHDQ02161 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHDQ02161 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHDQ02161 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHDQ02161 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms