Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKP1P63208 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SKP1P63208 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms