Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01547P58512 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms