Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGDP52209 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGDP52209 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGDP52209 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGDP52209 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGDP52209 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGDP52209 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGDP52209 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGDP52209 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGDP52209 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms