Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK8P49336 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK8P49336 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK8P49336 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK8P49336 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK8P49336 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK8P49336 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK8P49336 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK8P49336 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK8P49336 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK8P49336 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK8P49336 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK8P49336 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK8P49336 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK8P49336 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK8P49336 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK8P49336 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK8P49336 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms