Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJA8P48165 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJA8P48165 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJA8P48165 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJA8P48165 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GJA8P48165 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA8P48165 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA8P48165 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA8P48165 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA8P48165 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA8P48165 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA8P48165 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA8P48165 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA8P48165 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA8P48165 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA8P48165 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms