Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms