Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC1P35052 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms