Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms