Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2AP24928 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms