Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5F1P24539 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms