Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA1P23193 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA1P23193 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA1P23193 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA1P23193 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA1P23193 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA1P23193 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA1P23193 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA1P23193 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA1P23193 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA1P23193 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA1P23193 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA1P23193 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA1P23193 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA1P23193 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA1P23193 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA1P23193 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA1P23193 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA1P23193 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCEA1P23193 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA1P23193 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA1P23193 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA1P23193 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA1P23193 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA1P23193 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms