Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms