Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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