Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR35P0CG20 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms