Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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NPHP4O75161 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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NPHP4O75161 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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NPHP4O75161 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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NPHP4O75161 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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NPHP4O75161 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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NPHP4O75161 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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