Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCAO15360 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCAO15360 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCAO15360 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCAO15360 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FANCAO15360 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms