Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms