Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3CA6NKF2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms