Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC78A2IDD5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms