Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRQQ9UMZ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRQQ9UMZ3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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