Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRP1BQ9NZR2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms