Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM53CQ9NYF3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM53CQ9NYF3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms