Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALKBH4Q9NXW9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms