Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MED9Q9NWA0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED9Q9NWA0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms