Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM140Q9NV12 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms