Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RRP7BPQ9NSQ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RRP7BPQ9NSQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms