Protein–RNA interactions for Protein: Q9H714

RUBCNL, Protein RUBCNL-like, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNLQ9H714 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUBCNLQ9H714 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms