Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIOBPQ9H2D6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIOBPQ9H2D6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.9 ms